More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2130 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2130  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
116 aa  238  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  75.68 
 
 
114 aa  176  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  75.68 
 
 
114 aa  176  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  73.21 
 
 
128 aa  174  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  73.21 
 
 
131 aa  174  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  73.21 
 
 
134 aa  174  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  73.87 
 
 
114 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  73.87 
 
 
111 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  72.32 
 
 
134 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1359  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 
114 aa  158  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3272  ArsR family transcriptional regulator  72.32 
 
 
134 aa  155  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4519  ArsR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
120 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1295  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
110 aa  87  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0876  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4522  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  35.58 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  32.56 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
89 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
106 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  39.68 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2913  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850345  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 
95 aa  50.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  41.54 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  37.88 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  32.84 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  35.92 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  32.26 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  36.23 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  32.29 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 
106 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
297 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
110 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
111 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 
114 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 
113 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.84 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  32 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  32.43 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  36.23 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  35.37 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>