More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1295 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1295  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  223  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
131 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
134 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3272  ArsR family transcriptional regulator  50.63 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2130  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
116 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4519  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1359  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  43.48 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
230 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0876  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  30.67 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.55 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  36.59 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  37.23 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
89 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4522  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
107 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.21 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  38.16 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  32.58 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  38.36 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.93 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  40 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.93 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  35.53 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
104 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>