More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1936 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  214  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  46.91 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  38.2 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  46.75 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  30.59 
 
 		 358 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  43.06 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  36.36 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.57 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  30 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  33.62 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  35.87 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  42.65 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0550  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  44.93 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 349 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>