More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0191 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  49.25 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  42.05 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.33 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  47.14 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  36.59 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.03 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  45.83 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  37.18 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  43.59 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.53 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  40 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  38.75 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  39.39 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  40.79 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  47.22 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>