288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1359 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1359  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2130  transcriptional regulator, ArsR family  66.36 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  62.73 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  62.73 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  61.82 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 111 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3272  ArsR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4519  ArsR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1295  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0876  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  32.93 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4522  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 230 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  32.93 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  32.86 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  32.35 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  33.82 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>