More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1812 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 106 aa  207  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  70.97 
 
 		 193 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  63.44 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  68.18 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  59.14 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  62.65 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  58.62 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  54.88 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  50.54 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  45.05 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.78 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  37.97 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  40.28 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.53 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>