More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0824 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
110 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  66.99 
 
 
115 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  66.35 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  64.08 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  58.88 
 
 
111 aa  133  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  62.14 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  63.11 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  58.1 
 
 
137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  57.01 
 
 
144 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  60.19 
 
 
119 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  56.07 
 
 
131 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  57.69 
 
 
185 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  58.25 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  55.34 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  58 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  54.63 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.77 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  50.96 
 
 
112 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  50.45 
 
 
121 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
115 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 
122 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 
113 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  46.79 
 
 
118 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  54.37 
 
 
118 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  44.66 
 
 
123 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
137 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
146 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
119 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
111 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
115 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 
122 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 
122 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 
122 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
115 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  44 
 
 
111 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
330 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  47.52 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.66 
 
 
118 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  45.19 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  41.35 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
113 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  41.35 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
113 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
113 aa  87  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  43 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.78 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
107 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
103 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
109 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  43.88 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  40.95 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  43.69 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>