More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3941 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  228  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  81.42 
 
 		 113 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  76.99 
 
 		 113 aa  180  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  73.39 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  60.71 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  54.63 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  49.56 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  45.65 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  38.74 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  42.2 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  37.25 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  41 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  32.69 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  36.79 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  33.01 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 230 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  34.82 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  41.3 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  30.28 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  30.39 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 114 aa  66.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>