More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6764 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  62 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  55.1 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  57.58 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  46.94 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  48.98 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  51.06 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  49.02 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  48.11 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  35.58 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 193 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  38.95 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.82 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 330 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  39.56 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>