225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2913 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2913  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
89 aa  183  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850345  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6346  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 
89 aa  90.5  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
68 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
117 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2130  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  33.85 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  37.68 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
349 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3272  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  32.89 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  33.33 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  32.31 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  32.31 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  32.31 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  32.31 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  32.5 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  30.77 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
337 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 
108 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  33.78 
 
 
105 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
120 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
337 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 
122 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
347 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
324 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>