275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6346 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6346  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2913  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  34.62 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  32.2 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  36.71 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  36.49 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 341 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 341 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3272  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  32 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  33.82 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  33.82 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  33.82 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  33.82 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  33.82 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  33.82 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32.43 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 341 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3506  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1742  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.186267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0876  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  33.82 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  33.82 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40.98 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  34.78 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  45.16 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  35.71 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1295  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3682  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4519  ArsR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0293  transcription regulator ArsR family protein  30 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0169  transcription regulator ArsR family protein  30 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.537657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 349 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  29.73 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  36.25 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 342 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  32.91 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  32.1 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  32.89 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 337 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>