More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2432 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2913  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0577  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6346  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  41.33 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  37.5 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  39.13 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  37.8 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  32.05 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  28.92 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  39.19 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  37.1 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  29.41 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 355 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0500  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  39.71 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  36.62 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>