More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0211 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  100 
 
 
105 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  59.22 
 
 
104 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  59.22 
 
 
104 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  61.17 
 
 
104 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  38.95 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  50.75 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  50.75 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  37 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.79 
 
 
127 aa  60.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  28.89 
 
 
183 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  32.88 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
106 aa  57.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  34.15 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
89 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  35.29 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  39.71 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
94 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  37.31 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
341 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>