More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0018 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
108 aa  226  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  66.02 
 
 
112 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  64.49 
 
 
107 aa  146  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  57.94 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  54.87 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  54.87 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  43.33 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  40.45 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  60.32 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  45.45 
 
 
92 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  53.73 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  51.56 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44.74 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  39.45 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.61 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  45.33 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  44.44 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  43.04 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  40.54 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.68 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
128 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  45.59 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  46.05 
 
 
102 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.83 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  49.18 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  47.76 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  44.78 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
324 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  38.95 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>