290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3353 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  68.75 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.67 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40.96 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  35.23 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.97 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 		 263 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.11 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  26.09 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  43.66 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  35.05 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  35.05 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  42.25 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 437 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  28.87 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  40.62 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 330 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  51.67 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  37.5 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  31.91 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>