More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1116 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
117 aa  229  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  63.39 
 
 
112 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  67.68 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  56.07 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  62.64 
 
 
113 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
98 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  52.53 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  31.31 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.73 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  28.42 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  50 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  45.16 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  35.11 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  29.67 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  51.67 
 
 
250 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
104 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
121 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  24.51 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  45.9 
 
 
263 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
250 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
250 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
250 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  31.37 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  27.84 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  44.26 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  28.77 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>