125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0709 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 116 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 99 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.57 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  55.67 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.92 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.61 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 110 aa  93.2  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  43.69 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 		 123 aa  83.6  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  29.59 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  29.59 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  29.59 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  48.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  37.29 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  29.87 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  34.04 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  40 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2913  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>