103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4661 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 102 aa  84.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 121 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  36.94 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.96 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.1 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.79 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 117 aa  40  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>