272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0522 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.1 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  45.92 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 111 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  42.71 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  44.9 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  35.92 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.03 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 93 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>