148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0380 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  228  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  64.65 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  54.81 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.08 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  55.91 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  48.45 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 109 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  48.45 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  54.95 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.54 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.06 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  45.92 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  45.74 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  44.19 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  39.62 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  39.62 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  40.32 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 349 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  27.37 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  33.03 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  27.37 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  27.37 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>