106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0337 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  93.52 
 
 		 109 aa  206  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  80.56 
 
 		 121 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  67.62 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  46.53 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  44.55 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  45.79 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  45.1 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  33.67 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.8 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 123 aa  42  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 103 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 112 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  28 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 347 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  28 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  39.68 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  30.77 
 
 		 336 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 		 349 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>