140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0718 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  88.6 
 
 
114 aa  197  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  67.62 
 
 
109 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  67.62 
 
 
109 aa  161  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  67.62 
 
 
109 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  65.09 
 
 
121 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  47.17 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  48.51 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  45.19 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  36.54 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.86 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  36.79 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
127 aa  57  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
337 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  34.34 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 
103 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 
349 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  39.39 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>