276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4243 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  79.61 
 
 		 104 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  74.51 
 
 		 104 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  72.55 
 
 		 106 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 104 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  44.76 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  44.76 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  44.76 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  43.16 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  34.95 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>