166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08020 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
114 aa  229  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  81.58 
 
 
114 aa  191  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 
118 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  58.88 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  61.05 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.14 
 
 
103 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
102 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
102 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
102 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 
102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 
99 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 
113 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  44.33 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  43.88 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  37.11 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
121 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  41.76 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  45 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
103 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
99 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
127 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  45.76 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.94 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  28.26 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.94 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.38 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  27.06 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>