219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  81.58 
 
 		 114 aa  191  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  59.46 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  59.38 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  52.29 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.76 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  50.54 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  43.62 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  35.35 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  46.67 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  46.67 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  34.83 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.46 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  47.46 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 245 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  37.68 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 337 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>