113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2717 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  94.69 
 
 		 113 aa  222  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  70.41 
 
 		 111 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  69.39 
 
 		 99 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  65 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  66 
 
 		 111 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  65 
 
 		 111 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  65 
 
 		 111 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  64 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  62 
 
 		 109 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  61.86 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  43.48 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  32.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  33.85 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35.82 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2913  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  32.39 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 113 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>