109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0090 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  217  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  59.14 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  41.76 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  37.65 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 337 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  43.86 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 87 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 106 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 104 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  31.88 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  31.88 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 347 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40.22 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>