164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4138 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  96.36 
 
 		 111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  96.36 
 
 		 111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  94.55 
 
 		 111 aa  214  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  78.18 
 
 		 111 aa  176  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  81.63 
 
 		 99 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  69.7 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  68.69 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  66 
 
 		 113 aa  140  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.35 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  62.5 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 116 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  47.92 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 120 aa  84.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  43.43 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  42.35 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  33.64 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.06 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.86 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35.82 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>