94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0942 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  72.55 
 
 		 116 aa  163  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  60.36 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 99 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.7 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.68 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.78 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.61 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  47.31 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 111 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  40.43 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  34.96 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  32.35 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  33.73 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  40.98 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 127 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  40.98 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  30.56 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0317  regulatory protein ArsR  30.43 
 
 		 143 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>