142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2306 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  68.69 
 
 		 99 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.36 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  55.14 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.44 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  49.45 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  51.58 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  45.92 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  38 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0317  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  37.68 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  37.68 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  30.85 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>