105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0547 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  100 
 
 		 116 aa  240  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  72.55 
 
 		 120 aa  163  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.76 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.28 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  36.94 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  31.76 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  34.57 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  34.57 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  30.26 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  29.07 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 119 aa  42  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 124 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 123 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  29.07 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  38.57 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 337 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.88 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>