112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8136 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.88 
 
 
105 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
113 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  53.75 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.47 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  47 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
109 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  41.94 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  34.38 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
120 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 
109 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 
104 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  31.08 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
121 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 
109 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
103 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
109 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
104 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.1 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>