140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7389 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  209  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  62.89 
 
 		 111 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.4 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.86 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 111 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 103 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  49.45 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.62 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  39.8 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  43.56 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  48.31 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  32.26 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  32.79 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.15 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.32 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.32 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.85 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.32 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.32 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>