205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4195 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
118 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  92.23 
 
 
130 aa  187  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  63.16 
 
 
114 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  61.46 
 
 
114 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 
102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
102 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
102 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
102 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 
102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
102 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  51.55 
 
 
111 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.5 
 
 
103 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
111 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 
104 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
113 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  48.96 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
109 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  44 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
96 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  42.11 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  43.43 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 
109 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  37.78 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  33.01 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  33.01 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  49.25 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
97 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
116 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  34.48 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  34.48 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.75 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  28.92 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>