130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2189 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  92.86 
 
 		 99 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  79.09 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  77.48 
 
 		 111 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  77.48 
 
 		 111 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  78.18 
 
 		 111 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  70.71 
 
 		 113 aa  154  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  70.41 
 
 		 113 aa  154  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  67.35 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  62.89 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 102 aa  93.2  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 102 aa  93.2  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 102 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 102 aa  93.2  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 102 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 116 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 115 aa  84.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  43.3 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  44.66 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.19 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  43.27 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  41.86 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  30.69 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.06 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  30.99 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  43.08 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 111 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  32.84 
 
 		 107 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  27.69 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>