219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22810 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
113 aa  229  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  61.62 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.7 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  54.95 
 
 
115 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.34 
 
 
111 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
102 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
127 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
118 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  48.96 
 
 
103 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 
121 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 
114 aa  84  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  44.79 
 
 
111 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
111 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  41.3 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  50.44 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  40.2 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.62 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  50.88 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  49.15 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
107 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 
330 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>