230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3804 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 130 aa  253  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  88.89 
 
 		 118 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  62.37 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  59.38 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  61.62 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 102 aa  105  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 102 aa  100  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 102 aa  100  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 102 aa  100  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 102 aa  100  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 102 aa  100  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  55.79 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 99 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  45.63 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  47.37 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  42 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  37.11 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  36.63 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  49.25 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  34.48 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  34.48 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  32.76 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  37 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 335 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  42.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>