More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1086 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
116 aa  228  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  98.28 
 
 
116 aa  221  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  84.48 
 
 
146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  68.82 
 
 
97 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 
107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  63.95 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  55.81 
 
 
110 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  54.65 
 
 
138 aa  110  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  55.81 
 
 
110 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 
110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 
109 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 
109 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 
109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
108 aa  106  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  59.04 
 
 
109 aa  105  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  55.68 
 
 
103 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
103 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  47.19 
 
 
109 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  48.19 
 
 
109 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 
111 aa  94  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.57 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
111 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  47.12 
 
 
135 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  48.05 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  34.04 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  40.34 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  38.94 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  41.03 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  45.24 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  33.62 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  46.58 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  49.25 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  43.37 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  46.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  39.53 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.56 
 
 
107 aa  59.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40.79 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  47.69 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  39.17 
 
 
117 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.03 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37.21 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
121 aa  57  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
91 aa  57  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  33.05 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  43.9 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>