More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6304 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 107 aa  209  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  80.41 
 
 		 97 aa  160  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  70.97 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  70.97 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  59.77 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  57.33 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  57.33 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  57.33 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  58.44 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  59.15 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  58.44 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  48.68 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  45.78 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  44.71 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  37.62 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  38.46 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  44.29 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  49.25 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  50.82 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.21 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  37.21 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  39.08 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  43.02 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.11 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.89 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>