More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3936 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  223  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  76.15 
 
 		 109 aa  174  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  80.2 
 
 		 109 aa  173  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  80.2 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  60.55 
 
 		 110 aa  143  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  59.63 
 
 		 109 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  55.96 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  52.73 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  51.82 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  50.91 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  50.46 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  59.04 
 
 		 116 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  60.24 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  62.16 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  59.15 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 111 aa  94.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  40 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  45.76 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  43.08 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 472 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  46.55 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  32.08 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  31.07 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.47 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  40 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  34.78 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  38.36 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>