More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0646 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  434  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  66.51 
 
 
218 aa  290  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
223 aa  264  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  59.91 
 
 
221 aa  251  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
228 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  53.11 
 
 
222 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  50.23 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
224 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
224 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
230 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
224 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
224 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
224 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
231 aa  215  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  50.71 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
222 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  43.5 
 
 
223 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
233 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  48.34 
 
 
227 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  49.3 
 
 
221 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  49.77 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  47.64 
 
 
226 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  48.83 
 
 
221 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  51.69 
 
 
221 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
235 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
235 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
235 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  48.8 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
226 aa  174  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
253 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
220 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  44.63 
 
 
184 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
234 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  43.54 
 
 
221 aa  167  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
221 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
222 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
219 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
189 aa  155  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  37.06 
 
 
219 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  40.18 
 
 
232 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  57.94 
 
 
124 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  57.94 
 
 
124 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
114 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
125 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.14 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
110 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
110 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.17 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  44.71 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  39 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  42.22 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
111 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 
141 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.23 
 
 
123 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
109 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
122 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  37.27 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.64 
 
 
133 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.51 
 
 
380 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
115 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  51.72 
 
 
207 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
111 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
109 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 
112 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
113 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 
167 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
111 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
120 aa  62.4  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  38 
 
 
117 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
136 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
127 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.61 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
105 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 
111 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
98 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.26 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
109 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.37 
 
 
142 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 
91 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
105 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  44.07 
 
 
423 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  35.23 
 
 
106 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
137 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.96 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
139 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
101 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>