190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2711 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  100 
 
 
306 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  62.33 
 
 
295 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5584  transcriptional regulator, TrmB  56.54 
 
 
307 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.107073 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6802  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 
307 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5889  transcriptional regulator, ArsR family  51.63 
 
 
307 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20640  regulatory protein ArsR  45.27 
 
 
310 aa  285  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  42.41 
 
 
304 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  40.75 
 
 
322 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
96 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
172 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
172 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
96 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
96 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
96 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
100 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
100 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
96 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
96 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 
96 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
88 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
91 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
91 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
91 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
91 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
91 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
91 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
88 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 
91 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 
91 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.68 
 
 
92 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
91 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
96 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
117 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  34.62 
 
 
95 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
115 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 
94 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0229  regulatory protein, ArsR  30.95 
 
 
110 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00808889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 
98 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
95 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  42.37 
 
 
95 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
182 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  40 
 
 
99 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
109 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
139 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
98 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
108 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
109 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2840  transcriptional repressor PagR  33.33 
 
 
97 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.660839  hitchhiker  0.0000000107753 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 
95 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
97 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
95 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
84 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0160  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
101 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
121 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
109 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0127  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
99 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196561  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  38.98 
 
 
119 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
96 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
98 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  33.8 
 
 
198 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  40.3 
 
 
100 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
113 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  40.68 
 
 
95 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
198 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
92 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2515  putative transcriptional regulator, ArsR family protein  36.67 
 
 
97 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
95 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 
110 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 
95 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
124 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
124 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
124 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
115 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  42.17 
 
 
120 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1004  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000308504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 
109 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 
113 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
107 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  35.21 
 
 
95 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
117 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 
120 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 
213 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0207  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
97 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.239951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
99 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
99 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 
109 aa  45.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
99 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
101 aa  45.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>