More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6292 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.51 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  36.28 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  38.05 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  38.68 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  38.79 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.39 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 
112 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
124 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
250 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  32.99 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  37.27 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
330 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
247 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  43.82 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.18 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  46.67 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>