More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1841 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
103 aa  212  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  70.3 
 
 
102 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  70.3 
 
 
102 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  70.3 
 
 
104 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  70.53 
 
 
97 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  69.07 
 
 
101 aa  140  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  75.29 
 
 
106 aa  140  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  70.45 
 
 
129 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  66.28 
 
 
98 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.47 
 
 
100 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 
268 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  59.77 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 
104 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  48.91 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  55.17 
 
 
111 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  55.17 
 
 
111 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
250 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
250 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
250 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
247 aa  87.8  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  48.28 
 
 
250 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
263 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.84 
 
 
268 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  50.57 
 
 
263 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  51.16 
 
 
115 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.13 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  52.33 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.44 
 
 
270 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  45.98 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  45.24 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.7 
 
 
288 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
104 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  40.96 
 
 
266 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.5 
 
 
240 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  36.67 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
297 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
120 aa  53.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
330 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>