252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3302 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 129 aa  258  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  63.16 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  60.82 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  61.05 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  52 
 
 		 119 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 257 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.81 
 
 		 260 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  41.51 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  41.51 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 263 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  43.3 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.62 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.71 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  42.27 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.21 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  36.04 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 330 aa  57  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  32 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  28.74 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  42.5 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.8 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  28.42 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>