More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2578 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  100 
 
 
112 aa  224  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  83.78 
 
 
112 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
113 aa  184  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2568  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
70 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.211094  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  54.81 
 
 
110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  51.92 
 
 
113 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 
118 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
116 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  55.32 
 
 
109 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
113 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 
111 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 
330 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
120 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
119 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  51 
 
 
114 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  45.19 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
109 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 
117 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
111 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
111 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
118 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
118 aa  87.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
113 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  40 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  40 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.98 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  40.38 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  42.45 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  41.98 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  40.95 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  43.04 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  43.04 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
114 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  36.63 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>