227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3231 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
110 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  94.55 
 
 
110 aa  217  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  68.87 
 
 
110 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  58.56 
 
 
119 aa  146  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  63.16 
 
 
129 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  69.44 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 
267 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
257 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  46.23 
 
 
260 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.76 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  46 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  46 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
247 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  43.12 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.27 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  42.31 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  43.56 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.45 
 
 
288 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
250 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
250 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
250 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
106 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  37.89 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
176 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
197 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.51 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
230 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
107 aa  52  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  32.53 
 
 
97 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
94 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 
120 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 
130 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
110 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
103 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  39.44 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  38.67 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  29.2 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.14 
 
 
240 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
437 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>