120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0457 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  191  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  64.04 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  61.8 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  62.92 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  59.55 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 263 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 250 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  57.69 
 
 		 270 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  44.09 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  41.57 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.54 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.57 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.08 
 
 		 288 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  37.33 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  39.44 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  36.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.9 
 
 		 240 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  31.43 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  36.11 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  33.78 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  26.97 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>