204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1940 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
100 aa  199  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  62.35 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  57.61 
 
 
97 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  57.47 
 
 
103 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  57.14 
 
 
106 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
102 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
104 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
102 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
110 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  47.83 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  45.56 
 
 
107 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  45.56 
 
 
263 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.44 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 
268 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  50.6 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
250 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
250 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
250 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 
250 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
263 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
257 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.26 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.26 
 
 
270 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  40.66 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  42.22 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.57 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.67 
 
 
260 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  42.22 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
109 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 
111 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.86 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.48 
 
 
240 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  37.78 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  40.79 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
176 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
107 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
330 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
113 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
117 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>