More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2970 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  223  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  42.42 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
223 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  49.25 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.41 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.41 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  38.3 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
100 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  46.58 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
115 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  35.64 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  28.87 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  38.82 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
113 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  41.67 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  37.93 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  32.5 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  29.55 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
222 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
233 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  28.4 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  28.4 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  33.98 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
221 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
228 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>